O nome "Zika" foi dado ao vírus em 1947, quando foi isolado pela primeira vez na floresta de Zika, em Uganda. A palavra "Zika" significa "sobreposta" ou "espremida", em referência à forma como os mosquitos da espécie Aedes transmitem o vírus, picando e "espremendo" o sangue infectado em outro hospedeiro. Vale lembrar que, embora o nome do vírus seja o mesmo, o surto de Zika que se espalhou pelo Brasil em 2015 e 2016 é um subtipo diferente do que foi originalmente descoberto em Uganda.