Não existe um consenso sobre o significado exato do nome Yonei, pois se trata de um nome pouco comum e de origem incerta. Alguns estudiosos sugerem que pode se originar do hebraico Yoneh, que significa "pomba", enquanto outros afirmam que pode ter origem japonesa e significar "grande paz". Além disso, há também a possibilidade de que seja uma variação ou adaptação de outros nomes, como Yoná (Jonas) ou Yonit (Jonita).