Magdonio é um nome próprio masculino de origem incerta, e não existe um significado específico ou consenso a respeito do seu significado. Algumas teorias sugerem que possa ser uma variação ou derivação de outros nomes, como Magdônio (que teria origem grega e significaria "poderoso em honra"), Magdaleno (de origem espanhola, que se refere a Maria Madalena) ou ainda Magdala, que seria o nome de uma cidade mencionada na Bíblia. No entanto, não há uma confirmação definitiva sobre a etimologia ou significado do nome Magdonio.