O nome Joaquim Rafael é composto por dois nomes próprios de origens diferentes. Joaquim é um nome de origem hebraica e significa "aquele que Deus exaltou" ou "Deus estabeleceu". Já Rafael é um nome de origem hebraica e significa "curado por Deus" ou "Deus cura". Portanto, o significado combinado do nome Joaquim Rafael pode ser interpretado como "aquele que foi exaltado e curado por Deus".