Não há um consenso sobre o significado do nome Guatemi. Algumas fontes apontam que pode ser uma combinação de palavras indígenas, como "gua" (água), "té" (pé) e "mi" (meu), indicando um local onde o dono da terra coloca os pés na água. Também pode ser uma referência a Guatimozín, o último imperador asteca, ou uma homenagem à aldeia Guatemi, localizada no Mato Grosso do Sul.