A origem da família Minakata remonta ao período feudal do Japão, quando um guerreiro chamado Minamoto no Yoriyoshi lutou nas guerras Genpei nos séculos XI e XII. Ele foi um líder do clã Minamoto e lutou ao lado de seu filho, Yoshitsune. Depois que Yoshitsune foi forçado a cometer suicídio pelo imperador, Yoriyoshi retirou-se para a província de Mikawa na região de Chubu. Foi lá que a família Minakata foi fundada pelo guerreiro Tameyoshi Minamoto, um descendente de Yoriyoshi. Ele lutou em batalhas durante o final do período Sengoku (1467-1603), incluindo a famosa Batalha de Sekigahara em 1600. A família Minakata continuou a servir como samurais durante o período Edo (1603-1868), quando o xogunato Tokugawa governou o Japão. Eles mantiveram a posse de terras e gozaram de status elevado na sociedade japonesa. No final do período Edo, um membro da família, Minakata Kumagusu, tornou-se um renomado naturalista e pesquisador, estudando a flora e a fauna do Japão, além de línguas e culturas estrangeiras. Ele é considerado um dos primeiros cientistas modernos do Japão. Atualmente, a família Minakata continua a existir, mas com um número reduzido de membros. Eles mantêm sua tradição e história, enquanto se adaptam à sociedade moderna.